Identifikace molekul a kvantitativní analýza pomocí MS
Transkript
Indentifikace molekul a kvantitativní analýza pomocí MS Identifikace molekul • snaha určit molekulovou hmotnost, sumární složení, strukturní části molekuly (funkční skupiny, aromatická jádra, alifatické části, atd.) a kompletní strukturu molekuly • molekulová hmotnost - určení na základě M+., [M+H]+, [M-H]- iontů nebo aduktů s molekulou [M+Na]+, [M+K]+, [M+NH4]+, [M+CH3COO]-, [M+Cl]-, atd. - závislé na použité ionizační technice - někdy je vhodné kombinovat více technik - pokud zcela chybí molekulární ion použít šetrnější ionizaci (ESI, MALDI), snaha o tvorbu molekulárních aduktů na základě přídavku vhodného iontu (NH4+, Na+, K+, Ag+, Li+, CH3COO-, Cl-, atd.), změna napětí na vstupních elektrodách, změna průtoků sušících a zmlžujících plynů, změna teploty iontového zdroje • sumární složení - z kolika atomů jakého druhu je molekula složena - charakteristické zastoupení M a M+2 izotopů - Cl (3:1), Br (1:1) - charakteristická izotopická obálka některých atomů - Sn, Hg, atd. - využití analyzátoru s vysokou správností určení hmoty - čím menší chyba, tím je menší počet možných kombinací atomů pro danou m/z, návrhy pomocí softwaru, které jsou běžně dostupné - analyzátor s vysokou RP - lze určit náboj iontu podle diference mezi izotopickými píky 1/z, tzn. 1/2 pro dvakrát nabitý ion, 1/3 třikrát nabitý - FT-ICR, orbitrap, QqTOF 1 Identifikace molekul 181 1 kalkulace teor. hmotnosti, zastoupení izotopů určení náboje MR = 180 1 [M+H]+ ∆m/z = 1/1 182 183 91 0.5 0.5 91.5 [M+2H]2+ ∆m/z = 1/2 92 61 0.33 0.33 61.3 [M+3H]3+ ∆m/z = 1/3 charakteristické složení izotopů Sn 61.6 Identifikace molekul počet teoretických kombinací vs. správnost určení m/z [ppm] www.waters.com 2 Identifikace molekul výpočet sumárního složení 34 možností Identifikace molekul • strukturní části molekuly - určení na základě fragmentových iontů - funkční skupiny - většinou poskytují charakteristické ztráty (např. -OH: ∆m/z=18, COOH: ∆m/z=44) - větší celky molekuly - např. postranní řetězce, neutrální ztráty mastných kyselin z esterů (cholesterolestery), atd. - využití tandemové hmotnostní spektrometrie - pro strukturní analýzu jsou vhodné analyzátory, kde je možné dělat tandemová hmotnostní spektra do vyššího stupně, především pasti, případně hybridní analyzátory • kompletní struktura molekuly - ve většině případů nelze pomocí MS rozlišit izomery (polohové, optické, atd.) - u polohových izomerů někdy rozdílné intenzity fragmentových iontů, využití vysokoenergetických kolizí (určení poloh dvojných vazeb, větvení) nebo speciálních aduktů, které poskytují charakteristické fragmentové ionty (Li+) - nutná kombinace s dalšími spektrálními technikami, které dokážou rozlišit izomerie, uspořádání v prostoru, atd. - NMR, rentgenová krystalografie, UV, IČ - kombinace se separačními technikami (tR, retenční chování) - separace izomerů 3 Kvantitativní analýza pomocí MS • výhodou je vysoká selektivita (pro MS/MS experimenty) a citlivost • je třeba vyvarovat se potlačení odezvy konkurenční ionizací (další látky, matrice) • důležitá je volba standardu, nezbytné je použití vnitřního (interního) standardu pro potlačení vlivu matrice či kontaminace na účinnost ionizace analytu, použití vnějšího standardu není vhodné a většinou je nepřijatelné • nejpřesnější postup je pomocí izotopicky značeného standardu analytu • izotopicky značený standard obsahuje atomy s těžšími izotopy, které způsobují posun m/z ve spektru a tím odlišení signálu od neznačené látky - látky mají stejné chemicko-fyzikální vlastnosti - nejčastěji deuterace (2D), 13C, 15N - doporučený posun alespoň +3 jednotky m/z - vysoká cena izotopicky značených standardů • pokud je izotopicky značených standard nedostupný, pak lze jako interní standard alternativně volit analogickou sloučeninu nebo homolog • tento interní standard nesmí být přítomen ve vzorku, musí mít podobné vlastnosti jako sledovaný analyt (struktura, ionizační účinnost, účinnost extrakce, atd.) • většinou se přidává již při zpracování vzorku a koriguje i účinnost extrakce Kvantitativní analýza pomocí MS • kvantitativní výsledky jsou závislé na typu analyzátoru a ionizace - QqQ - standard pro kvantitativní analýzu, citlivý, rychlý a vysoká selektivita díky možnosti MS skenů, omezený rozsah a rozlišovací schopnost - při správně zvoleném standardu lze použít všechny typy analyzátorů - MALDI - obecně horší kvantitativní analýza díky nižší reprodukovatelnosti • metody kvantitativní analýzy - metoda interního standardu, externí se nedoporučuje - metoda přímého srovnání - koncentrace je počítána na základě srovnání se standardem o známé koncentraci (pouze jedna koncentrace) - metoda kalibrační přímky - kalibrační závislost interního standardu na koncentraci - metoda standardního přídavku • pro zvýšení citlivosti a selektivity se využívají pro kvantitativní analýzu často specální MS skeny - nejčastěji sken iontové reakce - vysoká selektivita 4 Využití MS skenů v identifikaci a kvantitativní analýze molekul Typy MS skenů • použití skenů pro identifikaci látek a kvantitativní analýzu (zlepšení citlivosti, selektivity) • jednoduché skeny: - základní sken, sken v určitém rozsahu - selektivní záznam vybraného iontu • MS/MS skeny: - sken produktových iontů - sken iontů prekurzoru - sken neutrálních ztrát - sken jedné nebo více iontových reakcí 5 Základní sken Full scan • měření hmotnostních spekter v plném rozsahu m/z - kompletní informace o iontech analyzované látky - možnost vyvolání spektra v určitém čase - průměrování spekter za určitý čas - záznam intenzity vybrané m/z v čase (Reconstructed ion current, RIC) - všechny typy analyzátorů - velké množství dat • měření hmotnostních spekter v omezeném rozsahu m/z - vyšší rychlost - vyšší citlivost - menší objem dat Základní sken m/z Q Intenzita měření v určitém rozsahu m/z sken U/V m/z 6 HPLC/MS analýza triacylglycerolů - základní sken TIC MS OLL RIC m/z = 603 [OO]+ Identifikace koeluce píků triacylglycerolů TIC 7 Identifikace koeluce píků triacylglycerolů 601 577 2 látky 575 603 [M2+H]+ [M1+H]+ 857 883 599 [M2+NH4]+ [M1+NH4]+ 874 900 Identifikace koeluce píků triacylglycerolů TIC RIC m/z = 883 RIC m/z = 857 8 TIC 601 577 signál 575 603 599 pozadí signál RIC m/z = 883 signál SLL [M+H]+ 883 [SL]+ 603 [LL]+ 599 RIC m/z = 857 pozadí [M+H]+ + 857 [M+H] 883 [OL]+ [OP]+ 601 577 + [LP] 575 [M+NH4]+ 900 OLP [M+H]+ 857 [M+NH4]+ 874 Identifikace stopových látek TIC 9 Identifikace stopových látek TIC RIC m/z = 689 689 tR = 107.0 min ECN = 56 LgOO [OO]+ 603 [LgO]+ 689 [M+NH4]+ 874 [M+H]+ 971 Selektivní záznam vybraného iontu Selected Ion Monitoring - SIM • výběr (filtr) jednoho iontu pomocí nastavených parametrů (U, V, B) • stále je měřena intenzita pouze jednoho iontu, ostatní ionty nejsou zaznamenány • výrazné zvýšení citlivosti oproti základnímu skenu, vhodné pro kvantitativní analýzu pro Q platí: m/z = 1 až 1 000 → 1/1 000 času na 1 ion, SIM = 100% času na 1 ion • možnost výběru několika iontů (peak switching) – úměrné snížení citlivosti! • Q, sektorové analyzátory • nelze použít analyzátory na principu pasti • nelze zpětně vyvolat spektrum 10 Selektivní záznam vybraného iontu m/z Q Intenzita Základní sken (m/z)1 sken U/V m/z m/z Q U/V=konst. (m/z)1 Intenzita SIM m/z HPLC/MS analýza triacylglycerolů - SIM LLL TIC m/z (LLL) = 879 SIM m/z = 879 Selektivita SIM 11 Sken produktových iontů Product Ion Scan - PR • zastaralý název sken dceřiných (Doughter ion scan) nebo fragmentových (Fragment ion scan) iontů • měří se produktové ionty po fragmentaci vybraného iontu prekurzoru • jedná se o měření MS/MS nebo MSn spekter z vybraných iontů • manuálně nebo plně automaticky v průběhu HPLC/MS analýzy • informace o struktuře látky, identifikace • všechny analyzátory s možností MS/MS (QqQ, IT, sektorové analyzátory, hybridní analyzátory, atd.) Sken produktových iontů MS spektrum q2 Q3 Intenzita Základní sken m/z Q1 (m/z)1 sken U/V m/z Sken produktových iontů Q1 q2 Q3 U/V=konst. CID sken U/V (m/z)1 Intenzita m/z MS/MS spektrum m/z 12 HPLC/MS analýza metabolitů galantaminu TIC, vzorek jater 1h po aplikaci Galantamin MS Základní sken auto MS/MS Sken produktových iontů Sken iontů prekurzoru Precursor Ion Scan - PI • zastaralý název sken rodičovských iontů (Parent ion scan) • pro vybraný produktový (fragmentový) iont se zjišťuje původní iont prekurzoru • poskytuje informace o struktuře látky • detekce vybrané funkční skupiny nebo detekce tříd sloučenin s podobnou strukturou na základě jejich charakteristického fragmentového iontu • zjednodušení spekter • zvýšení S/N • QqQ, sektorové analyzátory 13 Sken iontů prekurzoru Základní sken Q1 q2 Q3 Intenzita m/z MS spektrum sken U/V m/z Q3 sken U/V U/V=konst. CID Intenzita zjednodušení spektra Sken iontů prekurzoru q2 Q1 m/z vybraná m/z m/z Identifikace fosfoethanolaminů (PE) R 2CO CH 2 O COR1 O CH O CH2 O P O (CH 2)2NH 2 O- ESI-MS/MS m/z 814 Charakteristický fragment všech [M+Na]+ PE je m/z = 164 T.A. Lydic a kol., Anal. Bioanal. Chem. 394 (2009) 267 14 Identifikace fosfoethanolaminů (PE) ESI-MS celkového lipidového extraktu Základní sken Sken iontů prekurzoru +ESI-MS +ESI-MS/MS, Q3 = m/z 164 [M+Na]+ PE T.A. Lydic a kol., Anal. Bioanal. Chem. 394 (2009) 267 HPLC/MS analýza lipidů Fosfocholiny (PC) CH 2 O COR 1 R 2CO O CH O CH 2O P O (CH 2)2+N(CH 3)3 O- Sfingomyeliny (SM) [N(CH3)3(CH2)2OPO3H2]+ [N(CH3)3(CH2)2OPO3H2]+ CHOH CH CH (CH 2)12 CH 3 R 1O NH CH O CH 2 O P O (CH 2)2+ N(CH 3)3 O- 15 HPLC/MS analýza lipidů Základní sken HPLC/MS celkového extraktu lipidů z vaječného žloutku TIC PI, m/z = 184 PC + SM Sken iontů prekurzoru Q3 = konst. = m/z 184 Sken neutrálních ztrát Neutral Loss Scan - NL • detekce látek se stejnou funkční skupinou • ztráta stejné neutrální částice o určité m/z (např. alkoholy ∆m/z = 18) • zjednodušení spektra • zvýšení S/N • QqQ (skenování na obou kvadrupólech se stále stejným ∆m/z), sektorové analyzátory 16 Sken neutrálních ztrát Základní sken Q1 q2 Q3 Intenzita m/z základní sken sken U/V m/z Sken neutrálních ztrát Q1 q2 sken U/V CID Q3 sken U/V Intenzita m/z zjednodušení spektra ∆ m/z = konst. m/z Q3 je o ∆ m/z menší než Q1 ESI-MS celkového lipidového extraktu Charakteristická ztráta PE je m/z = 141 CH 2 O COR 1 R 2CO O CH O CH 2O P O (CH 2)2NH 2 O- Základní sken +ESI-MS Sken neutrálních ztrát +ESI-MS/MS, m/z 141 [M+H]+ a [M+Na]+ PE T.A. Lydic a kol., Anal. Bioanal. Chem. 394 (2009) 267 17 HPLC/MS analýza lipidů Základní sken HPLC/MS celkového extraktu lipidů z vaječného žloutku TIC NLS, ∆m/z = 141 PE Sken neutrálních ztrát fosfoethanolaminy (PE) sken Q1 a Q3 s ∆m/z = 141 Sken jedné nebo více iontových reakcí Selected Reaction Monitoring - SRM • podle IUPAC není označení MRM doporučováno • podobné skenu iontu prekurzoru, ale prekurzory jsou předem známy • výrazné zlepšení citlivosti, kvantitativní analýza • oproti SIM výrazné zlepšení selektivity • QqQ, sektorové analyzátory 18 Sken jedné nebo více iontových reakcí MS/MS spektrum (m/z)2 Intenzita Intenzita MS spektrum (m/z)1 m/z m/z m/z Q1 q2 Q3 U/V=konst. CID U/V=konst. (m/z)1 Intenzita SRM (m/z)2 čas HPLC/MS analýza lipidů Základní sken HPLC/MS celkového extraktu lipidů z vaječného žloutku TIC SRM LAr-PC, 806 184 SRM LAr-PC Q1 = konst. = m/z 806 Q3 = konst. = m/z 184 19 Porovnání MS skenů Sken Q1 q2 Q3 základní sken sken - - selektivní záznam vybraného iontu (SIM) konst. - - sken produktových iontů (PR) konst. CID sken sken iontů prekurzoru (PI) sken CID konst. sken neutrálních ztrát (NL) sken CID sken (konst. ∆m/z) sken iontových reakcí (SRM) konst. CID konst. 20
Podobné dokumenty
Stres a nespavost [PDF 720 kB]
který jejich aktivitu ještì více zesiluje. Proto spánková deprivace ovlivòuje oba systémy stresu souèasnì. CRH neurony
se vyskytují rovnìž v amygdale, která je dùležitou strukturou
pro vyvolání pod...
Johnsons levá
UV (IČ) pulsní laser, molekuly analytu v matrici dostatečně
separovány, není intermolekulární působení, analýza velkých
(i termolabilních) molekul, možné spojení s TOF (velké
molekuly – delší doba ...
Hmotnostní spektrometrie
• jako zdroj UV záření se používá
kryptonová výbojka s energií fotonů 10 eV
a minoritní 10.6 eV
• tato energie je větší než ionizační
Computational mass spectrometry
• spektrum normalizováno, odstraněny peaky s nízkou
intenzitou, hodnoty m/z zaokrouhleny na nejbližší vyšší
celé číslo spektrum X
• Y – teoretické spektrum vygener. z databáze sekvencí
• korelačn...
Doporučené postupy pro léčbu Alzheimerovy nemoci a dalších
léčbu Alzheimerovy nemoci
a dalších nemocí spojených
s demencí
K. Sheardová, J. Hort, R. Rusina, A. Bartoš, V.
Línek, P. Ressner, I. Rektorová
za Sekci kognitivní neurologie České
neurologické spol...
Hmotnostní analyzátory
- ionty s menší hodnotou m/z o stejné kinetické energii se pohybují rychleji, takže
se rychleji dostanou na detektor (“malé ionty letí rychleji”)
• měření spekter je velice rychlé a hmotnostní rozs...
PDF verze přednášek z hmotností spektrometrie
• ion prekurzoru - ion, který reaguje za vzniku konkrétních produktových iontů
- nepoužívá se termín "rodičovský ion"
• produktový ion - vzniká jako produkt po reakci z jednotlivých iontů prekurzor...
zde lze uvést Doporučeně - Krajský úřad
Krajský úřad Libereckého kraje, odbor dopravy (dále jen „KULK OD“), jako příslušný správní úřad
podle § 40 odst. 3 písmeno d) zákona č. 13/1997 Sb., o pozemních komunikacích, ve znění
pozdějších př...
(10) NMR pevné fáze a proteiny
pouze monomerní forma. V citované práci je velmi dobře popsána příprava a
krystalizace a autoři tvrdí, že stejný postup, lze použít i pro ostatní globulární
proteiny. Ačkoli je vzorek stabilní až d...