zde

ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE
JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH
BUDĚJOVICÍCH
ZPRÁVA O UKONČENÍ PROJEKTU
Projekt
Název projektu: Fylogeografie západoafrických hor na příkladu endemického motýla
jako modelového taxonu
Průběh řešení projektu :
Z prostředků ze studentského projektu byla podle původního plánu provedena izolace DNA
nasbíraných tkáňových vzorků okáče Bicyclus anisops, celkem byla DNA zizolována od více
než 200 jedinců. To je více, než bylo původně plánováno, je to ovšem nutné kvůli dále
popsaným metodickým komplikacím.
Z části osekvenovaných vzorků byly získány sekvence cytochrom oxidázy I (COI). Tato
data byla předběžně zanalyzována, zejména kvůli zjištění případných patternů. Posléze bylo
testováno několik dalších standardně používaným genových markerů (EFalpha, ITS, D-loop,
cytochrom B), ovšem u žádného z nich nebyla zjištěna dostatečná míra variability k
fylogeografickým analýzám. Proto bylo nutné změnit metodický přístup a využít podrobnější
marker, konkrétně mikrosatelity. Prostředky studentského projektu byly sice spotřebovány na
optimalizaci a testování variability výše uvedených standardních markerů, řešiteli se však
podařilo získat prostředky na dosbírání materiálu z dříve nezahrnutých lokalit i dalších druhů
a část laboratorních analýz od National Geographic Society.
Dosažené výsledky:
Vzhledem k neočekávaným metodickým komplikacím byla provedena pouze předběžná
analýza COI. Z zizolovaných vzorků bude dále testována variabilita mikrosatelitů, případně
budou zpracovány pomocí AFLP. Řešitel zároveň dosbírává další vzorky na dříve
neplánovaných lokalitách (tato zpráva je psána přímo na lokalitě studovaného motýla). Z
těchto důvodů je zatím předčasné zjištěné výsledné jakkoliv interpretovat a slouží zejména k
potvrzení toho, že v datech je „fylogeografický pattern“, který bude podrobněji analyzován a
interpretován po zpracování všech vzorků a dalších markerů. Přiložené obrázky jsou proto
spíše ilustrační.
Využitelnost dosažených výsledků a navazující práce:
Získané sekvence COI budou využity jako jeden z markerů k interpretaci fylogeografie okáče
Bicyclus anisops. Zbytek osekvenovaného materiálu bude využit k získání dalších markerů,
pravděpodobně mikrosatelitů. V současnosti je řešitel v Kamerunu, kde z prostředků
získaných od National Geographic Society sbírá vzorky na dříve neplánovaných lokalitách.
Zároveň řešitel průběžně zpracovává vzorky i dalších endemických druhů studované oblasti k
získání komplexních výsledků. Po analýze všech vzorků budou výsledky publikovány v
některém(ých) z vysoce profilovaných časopisů.