Diagnostika LB
Transkript
Průkaz specifickédeoxyribonukleovékyseliny v diagnosticelymeskéborreliózy HulínskáD.,VotýpkaJ., Serologic\ý průkaz Diagnostikapůvodcelymeskéboneliózy (LB)je od popsríní tétonemocia identifikacejejího původceBorrelia burgdorfer'(BB) postavenana prukazuspecifickýchprotilátekmetodou (ELISA) a protilátekpomocíimunoblotu(Westernblot).obězmíněnémetody jsou v naší laboratořiakreditovríny.Serologické metodyjsou velmi přesné,standardizovény,obecně přijatéa nejčastějivyužívanépři prukazuLB.Výhodou metodje vysoká specifičnost,a možnostpoměrnéhokvantitativníhostanoveníproti|átek.Zezasí|aného materiáluje pozitivita na|ezenav 14-50 % u Elisy av 23-26 oÁu imunoblofu. Vlastní prťkazprotilátekvšaknení průkazemakutníhoonemocnění, velmi častopotvrzujekontakts původcemonemocnění nebo prodělanéonemocnění.Vtomtosměrub:fo'áu někteých metodproblémemna|éú. zce|a negativnívzorky. Yýznan serologickýchmetod m:ůže byt ovlivněn i stále se více vyskytujícímiimunodeťrcientní stavyr,yšetřovaných pacientůa měnícíse antigennískladbou genomospeciés BB.Popsáníjednotliých serotypů,vícei méněpatogenních, vnášídalší problémydo serologickédiagnostiky.Problémem je i odlišnostantigenův jednotliqých oblastecha odlišnost,,divokých..a sbírkových-kultivovaných kmenůpoužívaných pro přípravuantigenůdiagnosticsýchsouprav.Zde můžedochézetkrozdílůmve qýsledcích laboratoří,kterépoužívají diagnostickésoupravyod ruznýchv1irobců.Výsledek by měl být vždydoprovénen sdělením'kÍery,místrrí, nebo sbírkoqikmen byl použiti kdy a kde byl kmen izolován.Využitímonoklonálníchlátek vznášído diagnostikydalšíproměnné, a nemůŽe odráůetměnící se antigennívybavení,kterázpůsobujev určitém regiónu onemocnění. Kultivace a mikroskopiclry průkaz. Přímý prtkaz BB je možnýpomocíkultivacev BSK mediu' mikroskopiív zástinu a pomocí imunofluorescence' imunoelektronopticky.Kultivacepůvodcenemocije obtížnápřiizolacích ztěIníchtekutin,úspěšnější je ztkáni. Nejlepšímzdrojempro kultivaci borrelií(BB) jsou infikovanáklíšťata, která obsahujídesetitisícespirochét. optická mikroskopiev zástinu, případnědoplněnáimunofluorescencí,se uplatňujejen při vyšetřování vzorkůs větší koncentracíborrelií.Výěžnějšíje již kombinaceelektronové mikroskopie s koncentrací vzorkůpomocícentrifuagacea imunosorbcedoplněnénegativnímbarvením.Tato dnes akreditovanámetodadokaže jižprukaz těl bonelií,určení druhu,identifikacičástitěl borrelií (flagella)nebo,,pobytové stopy..přítomnostiborreliíve formě cyst.DlouhodobáqitěŽnost metodyje od 2 do 7 Yoze zaslanéhomateriálu. Průkaz deoxyribonukleovélryseliny Borrelia burgďorferi Btzy po zavedenípolymeriízové řetězovéreakce(PCR,1988)'ale i velmi záhypo popsrání původcelymeskéborreliózy (1982)zkoušelanašelaboratořv retrospektivní studii moŽnost příméhoprůkazuDNA v tkaňoqýchtekutinácha ve tkríních.Pro nedostupnost komerčních setůpro prtkaz borrelióvéDNA muselijsme vyzkoušetřadu metodiki materiálů.Dozačátku roku 1996jsme lyzkoušeli postuppro izolaci DNA,vybrali setyprimeru_ specifických sekvencíz DNA chromozómuBorrelia burgdorferi.Vyzkoušeli variacetermálníchprogramů pro cyklery, zaved|ikontrolucitlivosti reakce.odtéhoždatajsme zaved|iparalelní vyšetření materiáluzasílaného na vyšetřeníserologickéa elektronoptické s vpžitím evidencevzorkůa pomocíprogramuEPI INFO. Časemjsme definovalipodmínkypro ýsledků vyšetření správnýodběri zacházenís lyšetřovanýmmateriálemi způsobhodnocenízískaných výsledků.Potěšilo nás,kdyžjsme později zjistí|i,že tatonašezávěryjsou v souhlase s publikovanými pracemipředníchza}trantčních pracovišť v problematicelaboratorní diagnostikylymeskéborreliózy.od roku 1996jsme vyšetřilipomocíPCR 18690vzorků tělníchtekutina tkríní.(Viztabulkač.1) Tabulka č'1:Počty lyšetřenóho materiálu v letech 1996.2003 Rok vyšetření 1996 Počet vyšetřených Vzorků PCR r43 r997 r998 1592 2446 2000 2001 2002 2003 2839 2548 2581 3186 18690 1999 Celkem 33s5 o vyšetření metodouPCR zájem narůstaltak,žeod roku 2000 bylo nutnékaždýrok omezovatpoěetvyšetření.Vedli nás k tomujak pohnutkyekonomickéi technickói qfzkumný zám&.omezili jsme především počtyvyšetřené k'rve.Zájemnásvedl k přednostnímu vyšetření mozkomíšního moku,výpotkůa tkání.VýběrsekvenceDNA Z genomubakteriemá rozhodujícíýznampro specifičnost a citlivost reakcePCR Při srovniíní primeru jsme měli možnostvyzkoušetprimery odvozenéz genůgenomovéi plasmidovéDNA. Kriteriem pro ýběr byla genetickástabilitavybranésekvence,specifiěnosta dostateěnácitlivost i při jednokrokovéPCR. ffiz tabulkaě.2) Tabulka č.2:Zkoušenéprimery pro průkaz DNA Borrelia burgdorferis.lato označení primeru Druh PCR Autor a rok publikace bb Jednokrokové,i nested Jednokrokové i nested Nested Rosa,P.A.,1991 Jednokrokové, a sonda Marconi,R.T.,1992 Jednokrokové' a sonda Marconi"R.T..1992 cc bb-cc LD BB Rosa.P.A..1991 Melchers.W..l99I Z čehoje primer odvozen Klonovany fragment genomu Klonovaný fragment genomu Klonovaný fragment genomu 165 rRNA genom 165 rRNA genom BG VS WK1.WK2 F7,F2 P41 Jednokrokové' a sonda Marconi.R.T."1992 Jednokrokové, a sonda Marconi,R.T.,1992 Jednokrokové, a sonda Jednokrokové, a sonda Jednokrokové, a sonda Jednokrokové. a sonda Kruooger,W.H.,1991 165rRNA genom 165rRNA genom Flagellin gen Lebech.A.M..1991 Flagellin gen Luft.B.J."1992 Jednokrokové, a sonda Luft.8.J.,1992 Gen P41 antigenu flagellin Gen P41 antigenu flagellin Gen 165rRNA Adam,T.,1992 Gen 165 rRNA OSPA Jednokrokové, a sonda Nested Luft.B.J.1995 OSPA L5,R5 Jednokroková, a sonda Manak,M.M.,1997 PlasmidováDNA OSPA gen OSPB 16S BBUTP-BBURT Luft,B.LI992 Plasmidová DNA, OSPA sen Specifičnost primeru pouŽívaných pro identifikacipůvodcelymeskéborreliózy nemusíbý vždyjednoznačnájakjsme si ověřili testovánímpoužívaných primeru s DNA z narostlé kultury sbírkoqýchkmenůrťuných bakterií.(viz tabu|ka3) Tabulka 3.: Specifita primerů používanýchpro identifikaci DNA Borrelia burgďorferi sensu lato .Srovnání s DNA některých sbírkoých mikroorganismů. IZo-LovANÁ Sbírkový mikrooragnismus Bacillus cereus DNA Označení kmene )* Bc 8/78 C orynebacterium murium Cor 35170 Enterobacter aerogens Ae I/43 Escherichia coli EcKI4Il59 Klebsiella ozaenae Klo 1/35 Micrococcus luteus M 8/58 Proteus hauseri PrK4157 Proteus morpanii Prm ll37 Proteus mirabilis Pnni26177 P seudomonas aerupinosa Ps 3 7 1 65 Serratia marcescens Sr 20161 Staphylococcus aureus Mau ll45 Pozitivita primerů při uvedenéteplotě anilingu )** LD LD OSPA VS BG bb.cc 47 57 57 47 47 37t55 T + + + -J- + + -r + t Ť T Yersinia enterocolitica Candida albicans Borrelia burgdorferis.s. Borrelia garinii Borrelia afzelii Y 1164 55/79 B31 )x M 1 9 2) x Kc90 )x ++ ++ -t--t- ++ ++ -r-T- -r-r ++ ++ ++ ! ++ TT )* CNCTC {zechoslovak National Collection of Type Cultures,SZÚ Praha )x Nrírodníreferenční laboratořpro lymeskouborreliózu 'CEM,SZÚ Praha )** Uveden nánevprimerua teplotaannealing,druhého kroku po|ymerénové řetězové reakce Ze získanýchvýsledkůje zřejmé,Že k identifikacije nutnépoužítvždy několik primerus odlišnýmisekvencemi.Dáleje nutnédůsledněpoužívatupozitivníchvzorkůdalšíidentiťrkaci produktu pomocídruhověspecifickéhybridizační sondy,případně restrikčníana|ýzunebo sekvenciproduktu.Vtabulcenejsouuvedenyvšechnyzkoušené organismyjejichžDNA byla vyšetřenaspeciťrckými primery pto Borrelia burgdorferi.Jednáseo následující druhy: Legionellapneumophila,Anaplasmaphagocytophilum,Human herpesI simplexvirus,Human herpes2 simplexvirus a Human herpes4 lymphocryptovirus, Human herpes5 cytomegalovirusaDNA 30 izolátů blíženeidentifikovanýchbakterií,kterékontaminovaly vzorky při kultivaci boneliív BSK mediu z lidskych i zvířecíchvzorků.Vyšetření výše uvedenýchdruhůDNA bylo při použitípollžívartých primeru k prukazu agenslymeské bonelliózy negativní.MnoŽství primerupoužívaných k identifikaciDNA Borrelia burgdorferi sensulatoje od počátkupoužívéní tétometodyvelkémnožství. JednokrokováPCR umožňujespolehlivěidentifikovat40-400fentogramů DNA Borrelia burgdorferisensulato v 1 mililitru tělnítekutinynebove vyšetřované tkani. Při obsahu20 fentogramů chromozomové DNA v jednéburíceBB, můžeme při ideálníchpodmínkáchptokazat2-21 spirochét.CitlivějšínestedPCR _ prokažei menšímnožství DNA v materiálu.Zvyšovéni citlivosti přinášívzrtsta1ící riziko kontaminace.U nestedPCR dochazík manipulaci s namnoŽeným produktemanziko kontaminaceje již reálnéatatometodase neupouživápři vyšetřovrání většíhomnoŽstvívzorků.JednokrokováPCR bezpečně odhalípatogenní spirochetémie, navícje možné u nípoužívat účinnou ochranupřed kontaminací- systému cÍlÍTy-over prevence.Pro zqýšeníspecifityje možnLedále použíthorky start.Přesto,Žepoěet je úlymeskéborrelióry v těle velmi nízkýv porovnánís jinými bakteriálnímii organismů virovými původcionemocněnístačí jednokrokováPCR prokrízatpůvodceBB v materiálu. Yiztabulka 4. Tabulka 4: Množstvíspirochétve vyšetřovaném materiálu nemocného jedince a nejnižší početpro úspěšnou izolaci DNA(podle B.L.Schmidta (1)) Druh materiálu Infikovanéklíště Krevníplasma Krevní plasma u pacientůs erythema migrarrÁ Moč Výpotek kloubní Mozkomíšnímok Plná krev Krevní sérum Početspirochét v materiálu vml 4 500-55000/iedinci Pod 50 Nejnižšípočet spirochét pro izolaci DNA v ml 4000 10 t0 Pod 50 50 5000-10000 r-20 Pod 50 Pod 50 ?(10) 10 10 100 50 Výs1edky Vybraný panel vyšetření Výsledkempokusůa srovnánís dostatečným počtemvyšetření bylqýběr postupupři vyšetření vzorkůna přítomnostDNA původcelymeskéborreliózy.Byl tak vytvořenpanelpro vyšetření,který byl z většíčástipřevzatdo akreditované metody.DNA se získáváz citrátové krevníplasmy(krvinkyv EDTě rychle hemolysují),nativníhomozkomíšního moku'nativďho qipotku aztkání ve fuziologickémroiloku.Yzorky se nesmízmrazovatmimoumístění tkáně v tekutémdusíku.Seruma močse k vyšetření nepoužívá.Tekutiny se koncentrujícentrifugací do 6000 g.K přípravěse používákomečních kitůpro izolaci geonomové DNA.Komerčně vyraběný mix pro amplifikaci v systému horký start obsahuje l0 Yoternp|átllizo|ovaného ze vzotku,vyvéženémnožstvídvou páru primeru Jedna sada primeru je odvozena z l6SrRNA genu geonomovéDNA a druhá sadaz OSPA genu plastidovéDNA Bonelia burgdorferz.Rozpustidlemje qýhradně sterilní destilovaná voda pro parenterální použítí,bez pyrogenů.Reakční směs o objemu nejméně25 mikrolitru je amplifiko vána v35 cyklech programu v teplotnímprofilu pro multiplex PCR. 10 % produktu je použito pro elektro forézu v T,5 %oagarczovém ge|u zapřítomnosti velikostního DNA markeru.Po obarveníje produkt odečítanproti pozitivním a negativníkontrole,velikostnímu markeru . Pozitivní vzorky jsou verifikovríny hybridizací nebo sekvenací. Yýsledky vyšetření materiálu podle druhu Během retrospektivnístudie jsme měli možnost zptacovávatmateriál zasí|anýzoddělení infekčních,neurologických, revmatologických a dermatologických, menšíčástvzorků i z jinýchpracovišť.Většinazaslanýchvzorků byla od pacientůs chronickou LB.Akutní případy jsme měli většinouz vlastních odběru, zřadpracovníků Státníhozdravotrrího ústavu velmi častos prokazatelným erythema migrans. Pruměrnéročníprocento pozitivity krevní plasmy bylo 9,8 oÁ (8,9-12,ÍYov posledníchtřech letech).U mozkomíšníhomoku bylo průměrné procento 8,0 "Á (s rozptylem 4,4-12 % v jednotliqych letech).Nejvyššíprocento pozitivních vzorků z pruměru posledních tří let bylo zjištěno u kloubních výpotků23,l%o(od' I4,| do 36 Yo rcčníchpruměru).Poměrná pozitivita u jednotliých druhůodpovídá qýsledkům jiných laboratoří používajících diagnostiku PCR pro identifikaci DNA Borrelia burgdorfer'.Nižšíprocento pozitivních vysledků u mozkomíšďho moku je dáno tím,že zptacovávámepÍevážněvzorky z chronických, častojiž \éčenýchpřípadů.Vesledovaném období jsme neměli možnostvyšetřit biopsie kůžezakutních případůs prťrkaznýmerythema migrans, kde bywá pozitivitanejvyšší' nad 50 %.(2). vyvoj procenta pozitivity během posledníchčtyřlet o roku 1998jsme zjistili kolísrín počtupozitivníchqfsledkův jednotlivýchletech.Počtyjsme v^áhli k pocT vyšetřenýchvzorkůa dostalitak ročníprocentopozitivity vyšetření v naší laboratoři.od roku 1998narůstalo procentopozitivity z IO na 17 Yov roce 2000.od tohoto vrcholu docházíkminimu v roce 2003(7 %),letosji žv pwétřetinězaznamenáváme mírný niírustpočtupozitir,níchvzorků.(Viz graf č.1) Graf č.1 Ročníprůměrpozltiviý PcR LB v procent.ech 18 -- 16 \ ./ 14 \. \ 12 10 I 6 4 2 0 rok 1998 rok í999 rok2000 rok2001 rok2}O2 rok2003 rok2oo4 Při porormánípoměrného počtuvyšetřenýchdruhůklinickéhomateriálu v posledníchletech zjišt'ujemežepoětypozitivníchvzorků v krvi ztlstávajípraktickystejné,počty pozitivních kloubníchvýpotkuse rychle zvyšují.Naopakpočtypozitivďch mozkomíšních mokůse dlouhodoběsniŽují.Tomůžesouvisetse změnoupočtujednotliqich genospeciésBB ve zkoumanýchoblastech. Niz grafč.2) Graf č.2 Graf č.2 40 35 30 25 20 15 10 5 0 rok rok rok rok 2001 2002 2003 2A04 Při měsíčnímrozboru počtupozitivních vzorků během roku jsme pravidelně zjišťovalidvě ročnímaxima. Jedno bylo na jďe,většinou v březnu aŽ květnu a pak na podzim v záňíaž ffjnu. Několikrát nás překvapil vysoký početpozitivních vzorků v lednu někteých roků.Situacese opakovala a tak jsme tomuto zjištěnívěnovali většípozornost.V jednotliých letech od roku l998 jsme stanovili ročnípruměr pozitivity a ten porovnali s počtypozitivních v měsíci lednu všech sledovaných let od roku 1998 do roku 2004.v letech 2OO0,200I a2OO3 jsme zjistili procento pozitivity v lednu vyššínežje pruměr pro celý rok. Přitom v letech 2001 a2003 byla tato odchylka velmi vyrazná.Yiz gtaf ě.3 Graf č.3 Lednové hodnoty pozitiviý v oÁa ročniprůměry 25 20 15 10 5 0 ffiffi %leden .p*.p"1p".p.1.*"tpŤ Zajíma|onás co ovlivnilo lednovó narusty pozitivity.Hledali jsme spojitost s oslabením organismuběhemprobíhající epidemie,nebo souvislosts wý,raznýmpodchlazením organismu a vývořenímpodmínekpro množení bonelíí(rustovéoptimumje u BB 32-33C)v akrálních částechtě14nebov podchlazenýchkloubech. Dalšípodezřeníbylo na užívání|éku snižujících obranyschopnost organismu(krtikoidy q) aumožňující vycestováníspirochétdo tělníchtekutin.Sledovalijsme i moŽnost,Že borrelieperzistující v organismučlověka prodělávajísvůjŽivotnícyklus a v určitýchobdobíse v organismupomnožíapŤipravítak podmínkypro následnoumoŽnostopuštění hostitelského organismuv rrámcidalšíhoživotního cyklu. Lednovéodchylky pozitivníchýs|edků proti ročnímuprůměru 14 12 10 8 6 4 2 0 € 4 rok í998 rok 't999 rok 2000 rok 2002 rok 2003 rok 2004 Citace: 1. Schmidt,B.L.,PCR in LaboratoryDiagnosisof HumanBorrelia burgdorferi Infections,Clinical Mikrobiology Reviews,Ian.I 997,p.I 85-201 2. lnformacez EUCALB 1997-2004EuropeanUnion ConcertedAction on Lyme Borreliosis http:i/vie.dis.strath.ac.ulďvie/LymeEU/diagnosis_clinical-features-pcr.html
Podobné dokumenty
Plechový proletář Fiat 126/127
Simku Présidentie||e
obdivovat na
montja|inském
zámku (Cháteaude
Montja|in)'kde stojíved|eda|Ších
speciálůdíve pouŽívanýchÍrancouzsktýmiprezidený.
1972.
4sek uspĚŠně absolvo v8li.
Úspésné-9konči1i přes nepřízeň poěasí zin&í prústup tradov]i;fií
dolinkalri kteřý byl uskutečněn v polovině května. ' Jsltc uspořádalj. zájezd aa !4r.yho chatu. opšt ná5
...
CHORUS Legionella pneumophila IgG
Použití silně hemolytických vzorků nebo vzorků s mikrobiální kontaminací může
vést k nereprodukovatelným výsledkům.
Než vložíte jednorázový test do přístroje, zkontrolujte, že reakční jamka
neo...
ODBĚRY VZORKŮ
odebírá cca 500 µl tekuté nebo polotuhé stolice nebo cca 1g (tj. asi velikost lískového
oříšku) tuhé stolice.
Nevhodně odebrané vzorky: Vodnatá, průjmová stolice, stolice v transportním mediu,
odbě...
Rozbory pitné vody v obcích Lhota a Vlasenice ze - Lhota
< - y^ledek pod mez detekce, > - rist€dekj€ ryJSi nez uvedend hodnota
Vysledky se rykaji pouze zkousentch vzorki
Bez pisemndho souhlasu laboratoie se desmi protokol reprodukovatjinak nez ce1i.
uved...