Hyphenated techniques
Transkript
„Hyphenated techniques“ „multidimensional analyses“ „life science research” Hyphenated techniques „omics“ genomics proteomics organellomics metabolomics cellomics Jan Preisler 312A14 [email protected] http://bart.chemi.muni.cz 1 „Hyphenated techniques“ Hyphenated techniques hyphen - spojit spojovníkem (dvě slova) hyphen - spojovací čárka (spojovník) hyphen - pomlčka hyphen - označit čárkou hyphen - rozdělit slovo (čárkou) hyphen - spojovací hyphen - rozdělovací čárka hyphen - rozdělovací znaménko hyphen - spojovník hyphenate - spojit hyphenate - rozdělit čárkou hyphenate - spojit spojovníkem hyphenate - rozdělit spojovníkem Definice “the marriage of two separate analytical techniques via appropriate interfaces, usually with the backup of a computer tying everything together” Analytical Chemistry (Wiley-VCH, 1998) “Hyphenated separation techniques refers to a combination of two (or more) techniques to detect and separate chemicals from solutions. Most often the other technique is some form of chromatography. A slash is sometimes used instead of hyphen, especially if the name of one of the methods contains a hyphen itself. Wikipedia (2007) 3 Hyphenated techniques 4 Hyphenated techniques ... zpravidla sestava některé separační techniky kombinovaná s jinou separační/detekční technikou, např. MS detekcí Současnost • kapilární separační techniky + vysoce citlivé detekční techniky (hmotnostní spektrometrie ESI a MALDI, elektrochemické aj.) • kombinace vysoké selektivity a vysoké citlivosti dovoluje jednoznačné stanovení analytů ve stopových množstvích ... specifičtější multidimenzionální analýza ... odstranění vzájemných rušení a překryvů signálu Rozhraní (interface) • zachování separační účinnosti • zachování citlivosti (minimalizace ztrát analytů) Co ještě je a co už není „hyphenated technique“? • LC – UV @ 254 nm záznam absorbance při zvolené l • LC – DAD diode array detector, záznam spektra Aplikace • multidimensionální analýza komplexních směsí: proteomika, dopingové testy, toxiny, pesticidy, speciační analýza polutantů... Více detekčních technik: „hypernated techniques“ 5 6 1 Typy spojení GC LC SFC CE TLC GE MS *** *** * ** * *** IR *** ** * * ** OES ** ** ** * AAS * ** ** Klasifikace spojení NMR ** Sběr eluentu • diskrétní frakce (fraction collector) • spojitý tok Fluo UV/Vis ** * *** *** *** *** *** Režim • on-line • off-line • in-line *** *** *** Využití vzorku • beze ztráty vzorku • se ztrátou vzorku (splitter) *** komerčně dostupné a v praxi používané ** komerčně dostupné, ale méně v praxi využívané * ve výzkumném stadiu, ale komerčně nedostupné Separátor (splitter) • rozdělení eluentu mezi více technik • miniaturizace, kapilární kolony 7 8 Př.: vzájemné rušení MALDI MS signálu směsi peptidů Spojení separace a selektivní detekce Proč separace? ... nutnost analýzy velmi složitých vzorků, směsí mnoha analytů 0.25 AF 1-7 AIII 0.20 c(peptidů) = 1 mM AII AF 3-8 0.15 AI 0.10 Ion Intensity (V) Když specifická detekce není dostatečně specifická: • vysoká pravděpodobnost výskytu 2 nebo více analytů se stejným spektrem • vzájemné rušení analytů • omezený dynamický rozsah detektoru, nemožnost současné analýzy minoritních a majoritních složek • odstranění nečistot • zdroj dalších informací o analytech AG 1-14 0.05 0.00 600 800 1000 0.25 1200 1400 AII (off scale) 1600 1800 2000 0.20 c(peptidů) = 1 mM 0.15 kromě c(AII) = 50 mM 0.10 0.05 0.00 600 800 1000 1200 1400 1600 1800 2000 m/z 9 10 Nejčastěji používané „hyphenated“ techniky HPLC-TLC (MALDI-TOF MS) všechny techniky spojené s MS, UV, Fluo Př.: • HPLC, CE – MS • GC-MS • GC-FTIR • LC-GC • GC-AES • LC-AAS • LC-ICP MS • LC-elektrochemické detektory • Probot 11 12 2 GC-AES LC-GC 13 LC-MS 14 LC-AAS 15 16 17 18 ICP-MS 3 19 HPLC–NMR–MS analysis of a commercial dye sample. A: HPLC (UV) spectrum at 254 nm. B: Photodiode array contour plot. C: Total ion chromatogram under negative ion electrospray conditions. D: Density plot of the negative ion electrospray mass spectra. E: 1H NMR spectra of peaks 1, 3 and 5 of the HPLC chromatogram in A 20 This example is for a 21 14C-labeled-blocker dosed to a rat. NMR and MS data for the minor hydroxyglucuronide metabolite clearly enables the structure to be determined. In addition, the drug was dosed as the racemate, but the NMR spectrum clearly shows that the metabolism (or excretion) was enantioselective based on the slightly different intensities of the anomeric proton resonances of the two diastereoisomeric glucuronides. 22 Příklad: spojení separace s MALDI MS Typy interface pro MS Plyn vakuum tryskový separátor pro obohacení ABC v nosném plynu (particle beam) membránové interface kapilární kolona (místo klasické kolony se splitrem) Off-line - Sběr frakcí. Terčíky s hydrofilními místy (anchorchip) - Vyříznutí a extrakce skvrny z GE - Mikrometody používající piezoelektrické pipetory a mikroterčíky Kapalina vakuum API ionizační metody (ionizace přímo z kapaliny za atmosferického tlaku) Průtokové sondy (FAB) Nanesení vzorku na tuhý nosič (terčík) pohyblivý pás (naneseni při atmosferickém tlaku – přenos, diferenciální pumpování - ionizace) Sběr frakcí 23 On-line - Průtoková sonda s fritou/bez frity - Zmlžovač pro tvorbu aerosolu In-line - Interface ROBIN - Nanášení vzorku na povrch ve vakuu, moving belt interface Off-line vs. on-line - Oddělení separace od hmotnostní analýzy - Možnost archivování vzorku 24 4 Automatizovaný sběr frakcí (off-line) Průtoková sonda (on-line) Whittal, R. M., Russon, L. M., Li, L. J. Chromatogr. A 1998, 794, 367-375. Např.: Probot (zdroj: www.lcpackings.com) 25 Zmlžovač pro tvorbu aerosolu (on-line) 26 Moving belt interface (in-line) • Rozhraní pro kontinuální zavádění netěkavého vzorku v těkavějším solventu do hmotnostního spektrometru horký N2 vyhřívací element štěrbiny LC eluent IR vyhřívání iontový zdroj pohybující se polyimidový pás k vakuovým pumpám • McFadden W. H., Schwartz H. L. and Evans S. J. Chromatogr. 122, 389, 1976. Fei, X., Wei, G., Murray, K. K. Anal. Chem. 1996, 68, 1143-1147. 27 ROBIN (rotating ball inlet), in-line 28 Nanášení vzorku ve vakuu (in-line) 2ND GENERATION VACUUM DEPOSITION INTERFACE atmospheric pressure source chamber (p ~ 10-6 Torr) deposition support repeller target coil probe with capillary interface flange source coil Mylar tape rubber wheel repeller center (tape guide) propelled shaft Orsnes, H., Zenobi, R. Chem. Soc. Rev. 2001, 30, 104-112. 29 30 5 CE - MALDI/MS směsi peptidů Multiplex: CAE – MALDI MS MULTIPLEX MALDI/TOF MS desorption laser beam scanning mirror ATMOSPHERIC PRESSURE tape buffer vials flight tube infusion capillaries interface flange repeller VACUUM (SOURCE CHAMBER) Multiplex: CAE – MALDI MS detector 2nd extraction grid 1st extraction grid Off-line CE – MS Capillary Array Electrophoresis - MALDI MS osmi proteinových digestů UV detekce 1 2 3 4 kapalinové spojení separace (CE) nanášecí kapilára myoglobin b-lactoglobin fetuin 5 6 b-casein 7 subatmosferická nanášecí komora (20 kPa) 8 broušená špička pokrytá PTFE cytochrome carbonic anhydrase bovine serum albumin terčík Au-PETG ribonuclease b 33 UV detektor: Ryvolová, M.; Preisler, J.; Krásenský, P.; Foret, F.; Hauser, P.C.; Paull, B.; Macka, M. Anal. Chem. 2010, 82, 129-135 34 CE – UV & SALD ICP MS of Cr specií Subatmospheric Deposition of CE Effluent 0.50 nanášecí sonda separační kapilára CrO42- 0.40 2.00 III(EDTA) III(EDTA) 1.50 CrCr 0.30 0.20 A (a.u.) kapalinové spojení integrated ICP MS signal (a.u.) × 610 2.50 CrO42- 1.00 0.10 0.50 infúzní kapilára 0.00 0 VN vialky s pufrem a vzorkem terčík MALDI 35 subatmosferická komora 30 60 time (s) 90 120 0.00 150 vzorek: 100 mM Cr3+(EDTA) a 100 mM CrO42- , BGE: 10 mM HCOOH, kapilára: 20/26 cm, 10 kV, dávkování: Dh = 2 cm, 5 s (200 fmol), detekce: absorbance při 214 nm/SALD ICP MS @ 53 (LOD ~ 10 fmol) Peš, O.; Jungová, P.; Vyhnánek, R.; Vaculovič, T.; Kanický, V.; Preisler, J. Anal. Chem. 2008, 80, 8725–8732 36 6 Terčík MALDI : multidetekční platforma Metaloproteomická aplikace vzorek, separační eluent, tkáň Kolonové separace – hmotnostní spektrometrie - prvková analýza: ICP MS terčík MALDI - molekolová analýza: elektrosprej (ESI) MS - kolonová separace + ICP MS/ESI MS laserem buzená fluorescence MALDI MS vzorek ICP MS separace ICP MS MALDI MS/MS ICP MS nebo reakce na terčíku separace ESI MS separace vzorek vzorek ESI MS dělič toku nebo duální přístroj Archivování/reanalýza/expozice jiným detekčním technikám 37 38 Modifikovaný terčík (destička) Absorbance (a.u.) Substrát - polyethylen tereftalát glykol (PETG) - nanovrstva Au: 5 nm pro kompatibilitu s MALDI a SALD 1,7 1,5 1,3 1,1 0,9 0,7 0,5 0,3 0,1 -0,1 MT-1 UV MT-2 7 8 9 10 11 12 6500 m/z 6400 MALDI MS: MT apoformy 6300 6200 6100 6000 7 8 9 10 11 12 destička Au-PETG se záznamem separace před a po SALD ICP MS 111Cd SALD ICP MS signal (a.u.) 600 000 destička Au-PETG na terčíku MALDI 500 000 400 000 SALD ICP MS: kovy (Cd) 300 000 200 000 Tomalová, I.; Foltynová, P.; Kanický, V.; Preisler, J. Anal. Chem. 2014, 86, 647−654. CE(UV)-MALDI MS/SALD ICP MS 100 000 0 7 39 8 9 10 tmig at liquid junction (min) 11 12 40 • CHCA/TFA: apoformy proteinů • DHB/NH3: komplexy proteinu s kovy [M-3H+2Cd]+ 1000 500 [M5H+3Cd]+ [M-7H+4Cd]+ [M+H]+ 1500 [M-H+Cd]+ MALDI MS integrated SALD ICP MS signal [a.u.]*106 Detekce formem proteinů MALDI MS 1 SALD ICP MS (111Cd) 0,9 0,8 0,7 0,6 0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 0 7 8 9 tmig[s] 10 DHB/NH3 600 400 200 0 6215.2 6145.2 800 CHCA/TFA 6241.3 Signal intensity [a.u.] 0 1000 6000 6200 6400 6600 6800 m/z 41 7
Podobné dokumenty
Miniaturizace v analytické chemii Předpoklady pro miniaturizaci
• DFMS (double-focusing magnetic sector mass spectrometer)
• rTOFMS (reflector time-of-flight mass spectrometer)
• SIMS (secondary ion mass spectrometry) TOF MS
ICP-MS
Dvojnásobně nabitých iontů: 56Fe2+ na 28Si+.
Tvorba aduktů: 40Ar16O+ na 56Fe+; 14N16O1H+ na 31P+.
Opioidy a renální selhání.
Renal impairment- nevhodný překlad doslovný- poškození ledvin umožňuje
spekulaci ve smyslu mechanického či úrazového poškození- přeloženo jako
renální insuficience s důrazem na funkčnost ledvin jak...
âESKÁ SPOLEâNOST PRO BIOCHEMII A MOLEKULÁRNÍ
Tryptické štěpy rhM-CSF-ß byly identifikovány MALDI-TOF MS, správnost identifikace
byla ověřena Edmanovým odbouráváním po
rozdělení na HPLC. Modifikace histidinových
zbytků byla doprovázena 80-90% ...
Vše o ginu Vše o ginu z Barlife 61 a 62.
Snaha dostat výrobu a konzumaci alkoholu pod
kontrolu dala v 18. století vzniknout i fenoménu
jménem Old Tom gin. Vzhledem k uzavření mnoha obchodů a výroben se začal rozvíjet černý trh
a tato pále...
zde - Magazín 1/2016
kreatin. V sekci screening se dozvědí o testech,
které napomáhají odhalit onemocnění v časném
a většinou i léčitelném stadiu.
„Pokud pacient dostal od lékaře výsledky testů
a varovně na něj bliká n...
Aerosolový slovník
Bulk analysis / Celková analýza - Analýza vzorku jako celku; na rozdíl od analýzy jednotlivých částic.