Biochemie 10 lipidy biosyntesa
Transkript
MASTNÉ KYSELINY, LIPIDY (BIOSYNTÉZA) OBSAH Syntéza • mastných kyselin • cholesterolu • žlučové kyseliny • isoprenoidy • steroly Rozdíly mezi odbouráváním a syntézou mastných kyselin 1. Syntéza mastných kyselin probíhá v cytoplasmě, odbourávání v matrix mitochondrií. Acetyl-CoA vstupuje do cytoplasmy ve formě citrátu. 2. Meziprodukty syntézy mastných kyselin jsou kovalentně vázány na sulfhydrylové skupiny ACP (acyl carrier protein), kdežto meziprodukty degradace jsou vázány na SH skupinu CoA. 3. Enzymy syntézy mastných kyselin vyšších organismů jsou spojeny do polypeptidového řetězce zvaného synthasa mastných kyselin. Enzymy degradace jsou v matrix volně. Rozdíly mezi odbouráváním a syntézou mastných kyselin 4. Řetězec mastných kyselin se prodlužuje o dva uhlíky z acetyl-CoA. Aktivovaným donorem dvou uhlíků je malonyl-CoA a prodlužování řetězce je poháněno odštěpováním CO2. 5. Redukčním činidlem při syntéze je NADPH, oxidačními činidly při degradaci jsou FAD a NAD+. 6. Prodlužování řetězce na synthase mastných kyselin končí tvorbou palmitátu (C16). Další prodlužování řetězce a tvorba nenasycených kyselin probíhá na jiných enzymech. Srovnání syntézy a odbourávání mastných kyselin Trikarboxylátový transportní systém Vstup acetyl-CoA do cytoplasmy • Membrána je nepropustná pro acetyl-CoA • Vstup do cytosolu ve formě citrátu • Cytosolová ATP-citrátlyasa (připomíná obrácenou reakci citrátsyntasy) • Transport citrátu do cytosolu je v rovnováze s transportem pyruvátu do mitochondrií • Reakce malát na pyruvát je zdrojem NADPH Zdroj NADPH pro syntézu mastných kyselin • Oxaloacetát je redukován za účasti NADH na malát cytosolovou malátdehydrogenasou: • Oxaloacetát + NADH + H+ malát + NAD+ • Malát je oxidačně dekarboxylován NADP+-malátovým enzymem (také jablečný enzym): • Malát + NADP+ pyruvát + CO2 + NADPH • Konečně pyruvát vstupuje do mitochondrie, kde je karboxylován pyruvátkarboxylasou: • Pyruvát + CO2 + ATP + H2O oxaloacetát + ADP + Pi + 2 H+ • Sumární rovnice: • NADP+ + NADH + ATP + H2O NADPH + NAD+ + ADP + Pi + H+ Transfer acetyl-CoA do cytosolu Biosynéza mastných kyselin Acetyl-CoA-karboxylasa Klíčovým krokem syntézy mastných kyselin je tvorba malonyl-CoA Acetyl-CoA + ATP + HCO3- malonyl-CoA + ADP + Pi + H+ • Katalyzuje acetyl-CoA-karboxylasa (obsahuje biotin). • Reakce probíhá ve dvou stupních: Acetyl-CoA-karboxylasa Struktura: • U E.coli – dvě podjednotky (biotinkarboxylasa a transkarboxylasa), biotin vázán na 3. podjednotce tj. protein přenášející biotinový karboxyl • U savců a ptáků – jeden polypeptidický řetěze má obě enzymové aktivity biotinkarboxylasa a transkarboxylasa Acetyl-CoA-karboxylasa Ptačí a savčí acetyl-CoA-karboxylasa je regulačním enzymem metabolismu mastných kyselin. • U savců a ptáků rychlost biosyntézy MK je regulována rovnováhou reakce: Protomer (neaktivní) ↔ polymer(aktivní) • Tvorbu polymerů pozitivně ovlivňuje citrát (aktivuje biosyntézu MK) • Rozpad polymerů iniciuje palmitoylCoA a AMP – zpětnovazebný inhibitor Acetyl-CoA-karboxylasa Ptačí a savčí acetyl-CoA-karboxylasa je regulačním enzymem metabolismu mastných kyselin. Hormonální regulace Glukagon, adrenalin, noradrenalin – spouští cAMP fosforylaci enzymu, která posouvá rovnováhu ve prospěch neaktivního protomeru Inzulin stimuluje syntézu mastných kyselin aktivací karboxylasy Insulin (glukagon a adrenalin mají opačný účinek). Poznámka U prokaryontních organismů je enzym acetyl-CoA-karboxylasa regulován prostřednictvím guanidinových nukleotidů → MK jsou syntetizovány v odpovědi na požadavky buněčného růstu. MK nejsou skladovány jako tuky, fungují jako prekursory fosfolipidů. Místa regulace metabolismu mastných kyselin Biosynéza mastných kyselin Jednotlivé kroky syntézy mastných kyselin 1 Syntéza malonyl-CoA acetyl-CoA-karboxylasa 2 Navázání acetyl-CoA na acetyltransacylasa CE 3 Navázání malonyl-CoA na malonyltransacylasa ACP 4 Kondenzační reakce: acylmalonyl-ACP-kondenzační enzym Acetyl-CE + malonyl-ACP acetoacetyl-ACP + (CE) + CO2 5 První redukce b-ketoacyl-ACP-reduktasa Acetoacetyl-ACP + NADPH + H+ D-3-hydroxybutyryl-ACP + NADP 6 Dehydratace 3-hydroxyacyldehydratasa D-3-Hydroxybutyryl-ACP krotonyl-ACP + H2O 7 Druhá redukce enoyl-ACP-reduktasa Krotonyl-ACP + NADPH + H+ butyryl-ACP + NADP+ Savčí synthasa mastných kyselin Savčí synthasa mastných kyselin Doména 1 (modrá): AT-acetyltransferasa, MT-malonyltransferasa, CEkondenzační enzym. Doména 2 (žlutá): ACP, b-ketoacylreduktasa (KR), dehydratasa (DH), enoylreduktasa (ER). Doména 3 (červená): thioesterasa (TE). Flexibilní raménka (zelená). AT MT DH ER KR ACP TE CE Cys SH SH TRANSLOKACE HS SH Cys REDUKCE TE ACP KR ER KONDENZACE DH MT Uvolnění palmitátu CE Vstup substrátu AT ACP – fosfopanteteinové raménko ACP – fosfopanteteinové raménko, meziprodukty syntézy mastných kyselin. na kterém jsou vázány Synthasa mastných kyselin- mechanismus reakce • Funguje jako dimer. • Ke kondenzaci dochází mezi malonylem zavěšeným na jedné podjednotce ACP a acetylem na SH kondenzačního enzymu druhé podjednotky. CE ACP CE SH S C ACP SH HS O O H3C H2C S ACP C C O CH3 KONDENZACE - O SH CE H2C CO2 S ACP C C O O SH CE Elongace řetězce Elongace řetězce je zahájena spojením acetylu na kondenzačním enzymu(CE), který je součástí synthasy mastných kyselin, s malonylem na ACP O H3C C S Acetyl-CE CE + - O O O C C C H2 KONDENZACE S Malonyl-ACP ACP H3C CE + CO2 O O C C C H2 S Acetoacetyl-ACP ACP Synthasa mastných kyselin- mechanismus reakce • Obě redukce a dehydratace na fosfopantheteinovém raménku ACP CE ACP CE SH HS CH3 H2C S ACP C C O ACP SH HS CH3 REDUKCE O H2C SH CE S ACP C H-C-OH CH2 O SH CE První redukce H3C O O C C C H2 S Acetoacetyl-ACP ACP REDUKCE H+ + NADPH HO H3C NADP+ O H C C H2 C S ACP D-3-Hydroxybutyryl-ACP Dehydratace HO H3C O H C C H2 C DEHYDRATACE S ACP D-3-Hydroxybutyryl-ACP H3C H2O O H C C C S H Krotonyl-ACP ACP Druhá redukce O H H3C C C C S H Krotonyl-ACP ACP REDUKCE H+ + NADPH H3C NADP+ H2 C O C H2 C S Butyryl-ACP ACP Synthasa mastných kyselin- mechanismus reakce • Translokací se přenese řetězec z ACP na SH skupinu kondenzačního enzymu stejné podjednotky CE ACP CE SH HS CH3 H2C S ACP C SH HS CH3 TRANSLOKACE H2C CH2 O SH CE ACP SH ACP O CH2 C S CE Synthasa mastných kyselin- mechanismus reakce • Další malonyl se naváže na raménko ACP druhé podjednotky. • Probíhá druhá kondenzace na protilehlou podjednotku dimeru CE ACP CE SH HS S HS O CH3 H2C SH ACP O ACP C CH3 H2C CH2 C Malonyl-CoA S CE CoA SH ACP O CH2 O CH2 C - S CE C O Pokračování syntézy •V dalším kole syntézy se kondenzuje malonyl-ACP s butyrylACP za tvorby C6-b-ketoacyl-ACP. • Poté následuje první redukce, dehydratace a druhá redukce za tvorby C6 – acyl ACP. • Prodlužování řetězce se opakuje až do délky C16 – palmitát. • Thioesterasa je enzym, který odštěpuje palmitát z ACP a tím je syntéza ukončena. Biosyntéza mastných kyselin Savčí synthasa mastných kyselin Stechiometrie syntézy mastných kyselin Stechiometrie syntézy palmitátu: Acetyl-CoA + 7 malonyl-CoA + 14 NADPH + 20 H+ palmitát + 7 CO2 + 14 NADP+ + 8 CoA + 6 H2O Stechiometrie syntézy malonyl CoA: 7 Acetyl-CoA + 7 CO2 + 7 ATP 7 malonyl-CoA + 7 ADP + 7 Pi + 14 H+ Celkově: 8 Acetyl-CoA + 7 ATP + 14 NADPH + 6 H+ palmitát + 14 NADP+ + 8 CoA + 6 H2O + 7 ADP + 7 Pi Prodlužování mastných kyselin • Prodlužování řetězce a tvorba nenasycených mastných kyselin probíhá na cytosolární straně membrány endoplasmatického retikula. • Aktivace s ATP • Tvorba dlouhých MK zejména v mozku • Biosyntéza v oddělených krocích (rozdíl od základní biosyntézy MK) • Acyl je vázán na CoA místo na ACP Desaturace mastných kyselin • Nutný molekulární kyslík • Tvorba oleoyl-CoA (cis D9-dvojná vazba) ze stearoyl-CoA: Stearoyl-CoA + NADPH + H+ + O2 oleoyl-CoA + NADP+ + 2 H2O • Savci nemají enzymy katalyzující vstup dvojné vazby za uhlík C-9 řetězce mastných kyselin. • Savci nemohou syntetizovat linoleát (18 : 2 cis D9, D12) a linolenát (18 : 3 cis D9, D12, D15). • Obě mastné kyseliny jsou pro savce esenciální – musí být dodány s potravou. Desaturace mastných kyselin Desaturace a prodloužení mastných kyselin • Polynenasycené MK - potřebné pro tvorbu signálních molekul • Zdroj jsou rostlinné oleje • Ryby nedokáží syntetizovat, ale akumulují je z potravy Biosyntéza složených lipidů • Většina enzymů je asociována s membránou endoplazmatického retikula Glycerol-3-P vzniká • v játrech redukcí glyceron-3-P nebo fosforylací glycerolu, který játra vychytávají z krve pomocí glycerolkinasy • v tukové tkání redukcí meziproduktů glykolýzy nebo glyceroneogenezí z např alaninu kys. asparagové a malátu (není přítomna glycerolkinasa) Souhrn metabolismu lipidů. • Novotvorba Glyceroneogeneze glycerol-3-fosfátu z pyruvátu, která je nutná pro reesterifikaci mastných kyselin, zejm. v tukové tkáni. • Až na poslední krok (redukci dihydroxyacetonfosfátu) se shoduje s první fází glukoneogeneze, klíčovým enzymem (limitujícím rychlost) je fosfoenolpyruvátkarboxykináza. • Dihydroxyacetonfosfát pro tvorbu glycerol-3-fosfátu pro syntézu triacylglycerolů má původ v glykolýze nebo z oxaloacetátu – glyceroneogeneze. • Při hladovění je asi 30 % mastných kyselin vstupujících do jater reesterifikováno na triacylglycerol a ten poté transportován VLDL. • Adipocyty v situaci hladovění vykazují také glyceroneogenezi. • Nemají glukoneogenezi, ale mají enzym glukoneogeneze – fosfoenolpyruvátkarboxykinasu (PEPCK), který je aktivován při nízkých hladinách glukosy. Převádí oxaloacetát na fosfoenolpyruvát (GTP). Eikosanoidy (20C) • Eikosanoidy (z řec. eikosi − dvacet) jsou sloučeniny odvozené od polyenových nenasycených mastných kyselin s řetězcem dlouhým 20 uhlíků (deriváty arachidonové kyseliny). Řadíme sem • leukotrieny • prostanoidů: prostaglandiny, prostacykliny a tromboxany. Vznikají především účinkem enzymů • cyklooxygenázy • cytochromu P450 • lipogenázy Eikosanoidy (20C) Prostaglandin E2 – PGE Objeveny v seminální plazmě. Vyskytují se téměř ve všech tkáních (ledviny, myokard, plíce, stěny arterií a jinde), ve kterých působí jako místní hormony. Thromboxany, objevené v trombocytech (dále leukocyty a žírné buňky). Leukotrieny - poprvé popsány v leukocytech. Eikosanoidy (20C) • Eikosanoidy jsou vnitrobuněčné signalizační molekuly (tzv. autokrinní), které ovlivňují svalový stah, srážení krve, bolest či například zánět. • Poločas eikosanoidů je mimořádně krátký, v řádu minut. • Eikosanoidy působí při velmi nízkých koncentracích a způsobují bolest a horečku. Regulují tlak krve, srážení krve a reprodukci. • Nejsou transportovány krví, ale působí lokálně v blízkosti buněk ve kterých se tvoří. Rozpadají se řádově v minutách a sekundách. Eikosanoidy (20C) • Hlavním enzymem syntézy prostaglandinů je prostaglandin H2 synthasa. Má dvě katalytické aktivity: cyklooxygenasa a peroxidasa. Označuje se COX ! • Aspirin inhibuje syntézu prostaglandinů acetylací specifického Ser prostaglandin H2 synthasy. • Další nesteroidní protizánětlivé látky jako ibuprofen a acetaminophen se nekovalentně váží na enzym a podobně blokují aktivní místo. CH3 C=O CH3 H3C C C H3C H H2 NH C COOH H Ibuprofen OH Acetaminofen Eikosanoidy (20C) Biosyntéza isopentenyldifosfátu a cholesterolu Biosyntéza isopentenyldifosfátu v cytoplasmě • Meziprodukty jsou 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA (HMG-CoA) a • HMG-CoA se převádí • v mitochondriích na acetyl-CoA a acetoacetát (ketolátky) • v cytosolu na mevalonát CYTOSOL H3C O O C C C H2 + S 2 H + 2 NADPH CoA O Acetoacetyl-CoA - + O O H3C C S CoA H2O CoA C H3C C H2 OH C C H2 CoA + 2 NADP+ O - O H3C C C H2 C C H2 CH2 Mevalonát O C OH OH S CoA O 3-Hydroxy-3-methylglutaryl-CoA (HMG-CoA) C H3C Acetyl-CoA CoA S Acetyl-CoA O - O MITOCHONDRIE C + C H2 CH3 C Acetoacetát O Biosyntéza isopentenyldifosfátu v cytoplasmě • Syntéza mevalonátu je klíčovým stupněm syntézy cholesterolu. • Redukce HMG-CoA enzymem HMG-CoA-reduktasou ireversibilním stupněm, kontrolním bodem syntézy. • Reduktasa je integrální součástí v endoplasmatickém retikulu. membránových je proteinů HMG-CoA + 2 NADPH + 2 H+ mevalonát + 2 NADP+ + CoA Biosyntéza isopentenyldifosfátu v cytoplasmě Rozvětvená dráha metabolismu isoprenoidů v savčích buňkách Biosyntéza cholesterolu Cholesterol: • Modulátor fluidity živočišných membrán • Prekurzor steroidních hormonů • Prekurzor žlučových kyselin • Prekurzor vitaminu D • Cholesterol má 27 uhlíkových atomů a všechny mají původ v acetyl-CoA. 21 H3C 20 18 CH3 19 CH3 2 3 HO 1 A 4 10 5 11 9 B 6 12 C 13 14 8 7 17 D 16 15 22 23 24 25 27 CH3 CH3 26 Syntéza isopentenyldifosfátu Syntéza cholesterolu se uskutečňuje ve třech stupních: A) Syntéza isopentenyldifosfátu, jako aktivní isoprenové jednotky. B) Kondenzace šesti molekul isopentenyldifosfátu za tvorby skvalenu. C) Cyklizace skvalenu řadou reakcí na tetracyklický produkt, který je bezprostředně převeden na cholesterol. COO - COO CH3 OH CH2 OH - COO CH3 ATP ADP Mevalonát ATP P O COO CH3 OH CH2 O - O + O 5-Fosfomevalonát 2- ADP ATP P O H2C CH3 OH CH2 O - - O + O ADP P O + O 5-Difosfomevalonát O 2- CH3 2- O PO3 CH2 O P O - CO2 + Pi O + O P O O + O 2- CH2 O P O - O + O P O + O 3-Isopentenyldifosfát O 2- Izomerizace isopentenyldifosfát – dimethylallyldifosfát H2C H3C CH3 CH3 3CH 2O PO 2PO 3 3CH 2O PO 2PO 3 3-Isopentenyldifosfát Dimethylallyldifosfát Biosyntéza cholesterolu Mechanismus kondenzace allylového substrátu • Mechanismus kondenzace allylového substrátu (dimethylallyldifosfát) s 3-isopentenyldifosfátem. • Kondenzace hlava – ocas. 3-Isopentenyldifosfát CH3 3PO 2PO 3 CH3 CH3 R H Allylový substrát PPi CH 2O H2C + CH 2O R 3PO 2PO 3 - CH2 H Allylový karbanion Geranyl, farnesyl • Geranyl = dimethylallyldifosfát + isopentenyldifosfát • Farnesyl = geranyl + isopentenyldifosfát 3PO 2PO 3 CH3 + H2C CH3 CH2 R C H2 CH3 CH 2O H CH 2O H2C CH3 + H 3PO 2PO 3 CH2 R H H Geranyl(10C)-(farnesyl-15C)-difosfát Geranyldifosfát CH3 3OPO2PO 3 H3C Dimethylallyldifosfát CH3 3- H2C OPO2PO 3 3-Isopentenyldifosfát PPi CH3 3- OPO2PO 3 CH3 H3C Geranyldifosfát Farnesyldifosfát CH3 OPO2PO 3 CH3 H3C Geranyldifosfát Dimethylallyldifosfát 3- CH3 3- H2C OPO2PO 3 3-Isopentenyldifosfát PPi CH3 CH3 CH3 H3C Farnesyldifosfát Farnesyldifosfát 3- OPO2PO 3 Skvalen • Skvalen = 2 x farnesyldifosfát + NADPH • Kondenzace hlava – ocas. CH3 3- OPO2PO 3 CH3 CH3 H3C Farnesyldifosfát Farnesyldifosfát + NADPH PPi + NADP+ + H+ CH3 CH3 CH3 CH3 CH3 H3C CH3 Skvalen CH3 Cyklizace skvalenu • Cyklizace skvalenu na lanosterol přes skvalen epoxid a protosterolový kationt O2 + NADPH + H+ H2O + NADP+ O Skvalen Skvalen epoxid H+ H H3C + CH3 CH3 H H H3C H CH3 CH3 H H+ HO H3C H CH3 Lanosterol HO CH3 CH3 H Protosterolový kation Lanosterol Základní struktura peroxisomu • Lanosterol přechází řadou reakcí na cholesterol. • odstranění tří methylů (3xCO2) • redukce jedné dvojné vazby NADPH • přesun druhé dvojné vazby H3C CH3 H3C CH3 CH3 H3C CH3 H3C 19 KROKŮ CH3 CH3 HO CH3 HCOOH + 2 CO2 HO H3C CH3 Lanosterol Cholesterol Regulace biosyntézy a transportu cholesterolu. Regulace aktivity HMG-CoA reduktasy • Krátkodobá regulace katalytické aktivity 1. kompetitivní inhibicí (úplná suprese vyžaduje dva regulátory – cholesterol z LDL a nesteroidní produkt syntetizovaný endogenně z mevalonátu) 2. allosterické efekty 3. kovalentní modifikace – reverzibilní fosforylace 4. Hormonální • Dlouhodobá regulace na úrovni koncentrace enzymu – jeho syntézy a odbourání Regulace HMG-CoA reduktasy vratnou fosforylací Inhibitory syntézy cholesterolu • Syntéza cholesterolu může být efektivně blokována třídou sloučenin zvaných statiny (např. lovastatin také s názvem mevacor). • Jedná se o silné inhibitory HMG-CoA reduktasy. HO COO - OH O (Ki = 1 nM) H3C H O CH3 H3C • Atherosklerosa !! Lovastatin CH3 Inhibitory syntézy cholesterolu Regulace biosyntézy a transportu cholesterolu. cholesterol z LDL • snižuje rychlost syntézy HMG-CoA reduktasy • zvyšuje rychlost syntézy acyl-CoA-cholesterol-acyltransferasy (ACAT) (esterifikace) Regulace transportu cholesterolu. • Regulací syntézy receptorů pro LDL. • Vysoké koncentrace cholesterolu uvnitř buňky potlačují syntézu receptorů pro LDL, nízké stimulují • Regulace rychlostí esterifikace tedy i rychlostí odbourávání volného cholesterolu. • ACAT (cholesterolacyl-transferasa) enzym katalyzuje esterifikaci cholesterolu je regulován vratnou fosforylací i dlouhodobou kontrolou Syntéza žlučových kyselin • Polární deriváty cholesterolu – vysoce efektivní detergenty Cholesterol O OH H3C COO - OH CH3 H3C SCoA CH3 H3C CH3 HO CH3 CH3 OH HO Trihydroxykoprostanoát OH CH3 Cholyl-CoA Taurin Glycin O OH H3C CH3 O NH COO CH3 HO CH3 OH - H3C CH3 CH3 OH Glykocholát HO CH3 OH Taurocholát - NH SO 3 Steroidní hormony Cholesterol je prekurzorem pěti hlavních tříd steroidních hormonů: • progestageny • glukokortikoidy • mineralokortikoidy • androgeny • estrogeny . Biosyntetická cesta tříd steroidních hormonů. Základní steroidní hormony Testosteron androgeny Aldosteron mineralokortikoid Kortizol glukokortikoidy Estradiol estrogeny Funkce steroidních hormonů • Progestagen jako progesteron – připravuje dělohu pro přijetí vajíčka. • Androgeny jako testosteron – vývoj sekundárních pohlavních znaků mužů. • Estrogeny jako estron – vývoj sekundárních pohlavních znaků žen, ovariální cyklus. • Glukokortikoidy jako kortisol – ovlivňují metabolismus sacharidů, proteinů a lipidů, inhibice zánětů. • Mineralokortikoidy jako aldosteron – regulace vylučování vody a solí ledvinami (zvýšení reabsorbce Na+ a vylučování K+ a H+ což vede ke zvýšení objemu a tlaku krve). Místo syntézy steroidních hormonů Hlavními místy syntézy steroidních hormonů jsou: • Žluté tělísko (Corpus luteum) pro progestageny. • Vaječníky pro estrogeny. • Varlata pro androgeny. • Kůra nadledvinek pro glukokortikoidy a mineralokortikoidy. Vitamin D • Kontrola hladiny Ca2+ a fosfátů. • Aktivním hormonem je kalcitriol. • Nejedná se o pravý steroid H3C CH3 H3C CH3 CH3 H3C CH3 H3C CH3 Ultrafialové záření HO HO 7-Dehydroxycholesterol H3C CH3 H3C Provitamin D3 CH3 H3C OH CH3 OH Kalcitriol (1,25-Dihydroxycholekalciferol) CH3 H3C CH2 HO CH3 CH2 HO Vitamin D3 (Cholekalciferol) • Vitamin Struktura vitaminu D2 D2 (ergokalciferol) má shodnou strukturu s vitaminem D3 až na vedlejší řetězec v poloze 17 ! CH3 CH3 • Vytváří se v kůži působením UV záření z rostlinného ergosterolu (je v mléce). CH3 H3C CH3 9 10 Ergosterol HO • Vitaminy D se ukládají v tucích. CH3 CH3 - kalcifikují se měkké tkáně, tvoří ledvinové kameny. vitaminy D. CH3 H3C • Vysoké hladiny vedou k intoxikaci • Pigmentace chrání před intoxikací CH3 CH3 CH2 HO Vitamin D2 (ergokalciferol) Isopentenyldifosfát Prekurzorem • terpenů • řetězců ubichinonu • chlorofylu • karotenoidů • vitaminu K Myrcen (bobkový list) Limonen (citronová silice) Zingiberen (zázvor) Vitamin K • Je syntetizován - rostlinami jako fylochinon - bakteriemi jako menachinon (střevní bakterie) • Je rozpustný v tucích • Je nezbytný - pro funkci několika proteinů podílejících se na srážení krve - v procesu mineralizace kostí, buněčného růstu a metabolismu proteinů cévní stěny. • Denní doporučený příjem je 0,5 - 1 mg • Díky jeho syntéze ve střevě je jeho nedostatek vzácný. • Zdroj: Zelené části rostlin, játra, rostlinné oleje, maso, pistáciové oříšky Ubichinon (Q10) • Podobnost s vitamínem K2 • Za výzkum koenzymu Q10 byla v roce 1978 Angličanu Peteru Mitchellovi udělena Nobelova cena. • Je obsažen ve většině lidských buněk, vyjma červených krvinek a buněk v čočce, kterým chybí mitochondrie. • Dvě základní funkce. 1. pomáhá v přeměnách v elektronovém transportním řetězci na membráně mitochondrií, například u akceptoru zvaného cytochrom bc1. 2. antioxidant v mitochondriích a lipidových membránách, brání tyto struktury před volnými radikály. • Koenzym Q10 je z části syntetizován v těle, z části je přijímám potravou. S věkem klesá podíl vlastní syntézy. V orgánech dochází k poklesu tkáňové koncentrace Q10. Vitamin E • Vitamin E je souhrnné pojmenování přírodních chemických látek (jinak též tokoferoly). • Patří mezi vitamíny rozpustné v tucích. • V organismu slouží jako důležitý antioxidant, chrání buněčné membrány před poškozením volnými radikály. Tokoferol chemický název α-tokoferol 5,7,8-trimethyltokol β-tokoferol 5,8-dimethyltokol γ-tokoferol 7,8-dimethyltokol δ-tokoferol 8-methyltokol Vitamin A (retinol) • Je rozpustný v tucích • Dvě přirozené formy – vitamín A1 (retinol) a vitamín A2 (3dehydroretin). • Je nutný pro 1. tvorbu rodopsinu, zrakového pigmentu používaného za nízkého osvětlení. Nedostatek vede k šerosleposti 2. důležitý antioxidant 3. je nezbytný pro vývoj epitelií, při jeho nedostatku buňky rohovatí (xeróza). • Zdrojem vitaminu A je alfa-karoten, beta-karoten a lykopen, což jsou oranžová a červená barviva. • Vitamín A vzniká z provitamínu A, tedy především z beta-karotenu. Fytol (20C) • Fytol (20C) = diterpenový alkohol • Je složen ze čtyř isoprenových jednotek. • Fytol-vedlejší řetězec chlorofylu je • Prekurzor vitaminu E a K1 Karotenoidy • Karotenoidy – barviva rajčat a mrkve. Absorbují světlo, protože obsahují konjugované dvojné vazby (mezi 400 až 500 nm). • Jejich C40 uhlíkatý řetězec je skládán z C5 jednotek až po geranylgeranyldifosfát C20, jehož dvě molekuly kondenzují způsobem hlava-ocas za tvorby fytoenu C40. • Fytoen přejde po dehydrogenaci na lykopen. Cyklizací obou konců lykopenu získáme b-karoten – prekurzor retinalu. Lykopen b-Karoten Triacylglyceroly z potravy • Triacylglyceroly ze střevní sliznice jsou z důvodu nerozpustnosti převáděny na micely za účasti žlučových kyselin. Žlučové kyseliny jsou amfipatické (obsahují polární i nepolární části), jsou syntetizovány v játrech a uvolňovány ze žlučníku. • Žlučové kyseliny obalí triacylglyceroly a usnadní tak funkci hydrolytickým lipasam. Např. glykocholát. O OH H H CH3 H CH3 HO H3C H OH Glykocholát N H COO - Lipoproteiny • Lipidy vázané na proteiny – kovalentní vazba, na proteiny je navázána – mastná kyselina, glykolipidový zbytek, fosfolipid, kotví proteiny v membráně • Lipoproteiny – částice tvořené z nekovalentně asociovaných lipidů a proteinů, působí jako přenašeče triacylglycerolů a cholesterolu v krevní plazmě Stavba krevního lipoproteinu Lipoproteiny • Chylomikrony transportují exogenní triacylglyceroly do střev • Lipoproteiny s velmi nízkou (VLDL), nízkou (LDL) a střední hustotou (IDL) přenášejí cholesterol z jater do tkání endogenní triacylglyceroly • Lipoproteiny s a vysokou hustotou (HDL) přenášejí endogenní cholesterol z tkání do jater Třída lipoproteinů Hlavní lipidy Chylomikrony triacylglyceroly VLDL endogenní triacylglyceroly, estery cholesterolu, cholesterol IDL estery cholesterolu, triacylglyceroly, cholesterol LDL estery cholesterolu, cholesterol, triacylglyceroly HDL estery cholesterolu, cholesterol LDL – hlavní transportér cholesterolu krví Model transportu triacylglycerolů a cholesterolu u lidí Funkce lipoproteinů Chylomikrony • Cíl - dopravit triacylglyceroly z potravy do svalu a adipozní tkáně a cholesterol z potravy do jater. • Vznikají ve střevní sliznici, uvolněny do střevní lymfy a do cév. • Adherese na vnitřním povrchu kapilár kosterního svalstva a tukové tkáně. • Hydrolýza triacylglycerolů lipasami • Monoacylglyceroly a MK jsou přijímány tkáněmi. • Chylomikronové zbytky s cholesterolem vstupují jsou vychytány játry. do oběhu a Funkce lipoproteinů VLDL • syntetizovány v játrech • transport lipidů a cholesterolu do tkání • receptorová endocytoza – vstup LDL do jater a dalších tkání HDL • opačná funkce než LDL • odstraňují cholesterol z tkání • HDL receptory • játra likvidují cholesterol přes žlučové kyseliny Receptorová endocytoza Ateroskleroza • Progresivní choroba začínající ukládáním lipidů v buňkách hladkého svalstva vnitřních tepen – stávají se fibrózními, zužují se a mohou se uzavřít • Vznik souvisí s hladinou cholesterolu v plasmě • Snížení rozkladu plasmových LDL v důsledku nedostatku LDL receptorů • Zvýšená rychlost tvorby IDL • Epidemiologické studie – vysoká hladina plasmových HDL má úzkou souvislost s nízkým výskytem kardiovaskulárního onemocnění Úloha LDL receptorů Hypercholesterolemie – plyne z nadprodukce nebo nedostatečného využití LDL a je vyvolána 1. Geneticky – familiární hypercholesterolemie (FH)– nedostatek receptorů pro LDL 2. Potravou s vysokým obsahem cholesterolu – podobný účinek jako FH – nadbytečný cholesterol z potravy potlačuje syntézu LDL receptorů Vlastnosti biologických membrán • Membrány tvoří vrstvené struktury o síle dvou molekul. Tloušťka membrán je mezi 6 nm až 10 nm. • Membrány obsahují hlavně lipidy a proteiny v poměru od 1 : 4 až 4 : 1. • Membránové lipidy jsou malé molekuly s částmi hydrofilními a hydrofobními. Vytváří lipidové dvojvrstvy. • Specifické proteiny zprostředkovávají různé funkce membrán. Proteiny slouží jako pumpy, kanály, receptory, přenašeče energie a enzymy. • Membrány jsou nekovalentní seskupení. • Membrány jsou asymetrické. Dvě strany biologické membrány se od sebe liší. • Membrány vytváří fluidní mozaiku. • Většina membrán je elektricky polarizována. Struktura plasmatické membrány Složení membrán Model tekuté mozaiky Vlastnosti - redistribuce a inzerce proteinů, fúze biomembrán, plasticita membrán, exocytóza, endocytóza, transport Lipidy Hydrofilní doména Hydrofobní doména Rostlinné membránové lipidy Steroly Pohyb fosfolipidů v membáně rychlý - v jedné vrstvě (2mm/s) pomalý - mezi vrstvami molekuly nejsou vázány kovalentně postranní difúze kmitání Pohyb sterolů poskakování rotace přepínání - „flippasa“ - přepínač - pomalá difúze ve vrstvě lipidů, - rychlý přesun mezi vrstvami lipidů (bez enzymu) Proteiny - podle asociace s lipidovou dvojnou vrstvou Proteiny periferní a integrované 4 třídy membránových proteinů - vázané na: 1. mastné kyseliny 2. prenylové skupiny 3. fosfatidylinositol 4. cholesterol (u rostlin nejsou známy) • • • • • • Funkce biologických membrán kompartmentace (oddělení) určitých složek transport molekul (permeabilní bariera) specifita membrány (informační procesy) metabolické děje transformace energie možnost změny tvaru Funkce proteinů plasmatické membrány Transport Enzymatická aktivita Signální přenos Mezibuněčné spoje (živ.b.) Vzájemné rozpoznávání buněk(živ. b.) Připojení k cytoskeletu Funkční Příklad Specifická funkce třída proteinu Přenašeče Sodná pumpa Aktivně čerpá Na+ ven z (Na+/K+-ATPáza buněk a K+ do buněk Spojníky Integriny Spojuje aktinová filamenta uvniř buňky s proteiny extracelulární matrix Receptory Receptor Váže příslušný růstový destičkového faktor a generuje růstového intracelulární signál pro růst faktoru a dělení buňky Enzymy Adenylátcykláza Tvorba cAMP, odpověď na extracelulární signály
Podobné dokumenty
C - Základy biochemie
• 2. Meziprodukty syntézy mastných kyselin jsou kovalentně
vázány na sulfhydrylové skupiny ACP (acyl carrier protein),
kdežto meziprodukty degradace jsou vázány na SH skupinu CoA.
• 3. Enzymy synté...
Metabolismus lipidů - Ústav lékařské biochemie
– acetyl-CoA nemá dostatečnou energii, aby vstoupil do reakcí
– „aktivující reakce“ pomocí acetyl-CoA karboxylasy
• acetyl-CoA karboxylasa obsahuje dvě podjednotky, na každou z
nich je kovalentně k...
a l-dimethylamino-2-methylpentadienu
( 4 8 % ) a p ř i k a p á v a l i r o z t o k b r o m u , jenž obsahoval 1 g b r o m u v
100 cm' kyseliny b r o m o v o d í k o v é , tu již první k a p k a způsobila vy
loučení žlutého p e r b r ...
Makromolekuly v BS
Většinou zakotveny GPI
kotvou v membráně
(modifikace probíhá v ER katalyzována
transamidázou; po odštěpení peptidu na Ckonci je připojena
glykosylfosfatidylinositolová kotva inositolový ifosfolipi...
Halogenalkany + + -
setkáváme v průběhu celého semestru OCH I. Z toho důvodu se omezíme pouze na reakce
Bioprospect_1_11.qxd:Layout 1
Ačkoli jsou geneticky modifikované (GM) rostliny
běžně dostupné na trhu, s GM živočichy to je mnohem
složitější a dosud žádný z nich nebyl povolen k prodeji.
Nejblíže potenciálně komerčnímu využití...
Biochemici - USA_Kanada_1
se Best ve věku 30ti let stal v Torontu vedoucím Katedry fyziologie. Po
Bantingově smrti v r. 1941 se stal ředitelem Katedry medicínského výzkumu
Bantinga a Besta, tuto pozici držel do r. 1967, kdy...
Výroční zpráva ÚDMP za rok 2015 - Ústav dědičných metabolických
Organické acidurie – glutarová acidurie 1
Poruchy β-oxidace mastných kyselin - MCADD 3
Ostatní - Hydroxyprolinémie 1
Případy dříve diagnostikované, konfirmace v roce 2015 - 18
Výroční zpráva ÚEB AV ČR, v. v. i. za rok 2006
bramboru (TGBp1 PMTV)). Exprese antigenu byla provedena v E. coli a byla generovaná protilátka.
Získané protilátky nereagovaly v DAS formátu ELISA testu, což ukazuje na to, že antigeny, proti
který...